Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scp2d1Q9DAH1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scp2d1Q9DAH1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scp2d1Q9DAH1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Scp2d1Q9DAH1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scp2d1Q9DAH1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scp2d1Q9DAH1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scp2d1Q9DAH1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scp2d1Q9DAH1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scp2d1Q9DAH1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scp2d1Q9DAH1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scp2d1Q9DAH1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scp2d1Q9DAH1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scp2d1Q9DAH1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scp2d1Q9DAH1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scp2d1Q9DAH1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scp2d1Q9DAH1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scp2d1Q9DAH1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scp2d1Q9DAH1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms