Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9D9S1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q9D9S1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9D9S1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9S1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9S1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9S1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9D9S1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9D9S1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9D9S1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9D9S1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9D9S1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9D9S1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9D9S1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9D9S1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9D9S1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9D9S1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9D9S1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9D9S1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9D9S1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9D9S1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9D9S1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9D9S1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9D9S1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9D9S1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9D9S1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9D9S1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9D9S1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9D9S1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9D9S1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9D9S1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9D9S1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9D9S1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9D9S1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms