Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp12Q9D9M2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms