Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Actrt1Q9D9J3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actrt1Q9D9J3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms