Protein–RNA interactions for Protein: Q9D968

Hcfc2, Host cell factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc2Q9D968 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hcfc2Q9D968 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms