Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capns2Q9D7J7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capns2Q9D7J7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms