Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chmp4cQ9D7F7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp4cQ9D7F7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms