Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc39Q9D5Y1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc39Q9D5Y1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms