Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lpcat2bQ9D5U0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms