Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Atad1Q9D5T0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atad1Q9D5T0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms