Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Spsb1Q9D5L7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms