Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J6

Shpk, Sedoheptulokinase, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShpkQ9D5J6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ShpkQ9D5J6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ShpkQ9D5J6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ShpkQ9D5J6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ShpkQ9D5J6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ShpkQ9D5J6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ShpkQ9D5J6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ShpkQ9D5J6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ShpkQ9D5J6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ShpkQ9D5J6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ShpkQ9D5J6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ShpkQ9D5J6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ShpkQ9D5J6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ShpkQ9D5J6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms