Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930449I24RikQ9D5E3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930449I24RikQ9D5E3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930449I24RikQ9D5E3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930449I24RikQ9D5E3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930449I24RikQ9D5E3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930449I24RikQ9D5E3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
4930449I24RikQ9D5E3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930449I24RikQ9D5E3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930449I24RikQ9D5E3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms