Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn11Q9D572 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn11Q9D572 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms