Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc83Q9D4V3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc83Q9D4V3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc83Q9D4V3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc83Q9D4V3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc83Q9D4V3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc83Q9D4V3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc83Q9D4V3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc83Q9D4V3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms