Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms