Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms