Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Phf6Q9D4J7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Phf6Q9D4J7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms