Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sohlh2Q9D489 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sohlh2Q9D489 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sohlh2Q9D489 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sohlh2Q9D489 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms