Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpn3Q9D3W4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gpn3Q9D3W4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms