Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Z4

Senp8, Sentrin-specific protease 8, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp8Q9D2Z4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Senp8Q9D2Z4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Senp8Q9D2Z4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Senp8Q9D2Z4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Senp8Q9D2Z4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Senp8Q9D2Z4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Senp8Q9D2Z4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Senp8Q9D2Z4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Senp8Q9D2Z4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Senp8Q9D2Z4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Senp8Q9D2Z4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Senp8Q9D2Z4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Senp8Q9D2Z4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Senp8Q9D2Z4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Senp8Q9D2Z4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Senp8Q9D2Z4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Senp8Q9D2Z4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Senp8Q9D2Z4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Senp8Q9D2Z4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Senp8Q9D2Z4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Senp8Q9D2Z4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Senp8Q9D2Z4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Senp8Q9D2Z4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Senp8Q9D2Z4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Senp8Q9D2Z4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms