Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D2Q3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms