Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trmt44Q9D2Q2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Trmt44Q9D2Q2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trmt44Q9D2Q2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trmt44Q9D2Q2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trmt44Q9D2Q2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trmt44Q9D2Q2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trmt44Q9D2Q2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trmt44Q9D2Q2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Trmt44Q9D2Q2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trmt44Q9D2Q2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trmt44Q9D2Q2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trmt44Q9D2Q2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trmt44Q9D2Q2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trmt44Q9D2Q2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trmt44Q9D2Q2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trmt44Q9D2Q2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trmt44Q9D2Q2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trmt44Q9D2Q2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Trmt44Q9D2Q2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trmt44Q9D2Q2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trmt44Q9D2Q2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trmt44Q9D2Q2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trmt44Q9D2Q2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trmt44Q9D2Q2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trmt44Q9D2Q2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms