Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Susd3Q9D176 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Susd3Q9D176 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms