Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem88Q9D0N8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem88Q9D0N8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms