Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfc5Q9D0F6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfc5Q9D0F6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms