Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Gtf2e1Q9D0D5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gtf2e1Q9D0D5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Gtf2e1Q9D0D5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gtf2e1Q9D0D5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gtf2e1Q9D0D5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gtf2e1Q9D0D5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gtf2e1Q9D0D5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gtf2e1Q9D0D5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gtf2e1Q9D0D5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gtf2e1Q9D0D5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gtf2e1Q9D0D5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gtf2e1Q9D0D5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms