Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mms19Q9D071 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms