Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc47Q9D024 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc47Q9D024 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms