Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cmss1Q9CZT6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cmss1Q9CZT6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms