Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Thumpd2Q9CZB3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Thumpd2Q9CZB3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 460.5 ms