Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYR0

Ssbp1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp1Q9CYR0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssbp1Q9CYR0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms