Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmem39aQ9CYC3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmem39aQ9CYC3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmem39aQ9CYC3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmem39aQ9CYC3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmem39aQ9CYC3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmem39aQ9CYC3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmem39aQ9CYC3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem39aQ9CYC3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem39aQ9CYC3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem39aQ9CYC3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem39aQ9CYC3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem39aQ9CYC3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem39aQ9CYC3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem39aQ9CYC3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem39aQ9CYC3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem39aQ9CYC3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem39aQ9CYC3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem39aQ9CYC3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem39aQ9CYC3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem39aQ9CYC3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem39aQ9CYC3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem39aQ9CYC3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem39aQ9CYC3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem39aQ9CYC3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmem39aQ9CYC3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem39aQ9CYC3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem39aQ9CYC3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem39aQ9CYC3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem39aQ9CYC3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem39aQ9CYC3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem39aQ9CYC3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem39aQ9CYC3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem39aQ9CYC3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem39aQ9CYC3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem39aQ9CYC3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem39aQ9CYC3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem39aQ9CYC3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem39aQ9CYC3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem39aQ9CYC3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem39aQ9CYC3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms