Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gins3Q9CY94 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gins3Q9CY94 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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