Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
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Sgo1Q9CXH7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Sgo1Q9CXH7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Sgo1Q9CXH7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Sgo1Q9CXH7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Sgo1Q9CXH7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Sgo1Q9CXH7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Sgo1Q9CXH7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Sgo1Q9CXH7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Sgo1Q9CXH7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Sgo1Q9CXH7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sgo1Q9CXH7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgo1Q9CXH7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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