Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbm8aQ9CWZ3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rbm8aQ9CWZ3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms