Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd4Q9CWX4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 464.5 ms