Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ndufaf1Q9CWX2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms