Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tdrd12Q9CWU0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms