Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smyd3Q9CWR2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smyd3Q9CWR2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms