Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BccipQ9CWI3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms