Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NubplQ9CWD8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NubplQ9CWD8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms