Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Sycp2Q9CUU3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Sycp2Q9CUU3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Sycp2Q9CUU3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Sycp2Q9CUU3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Sycp2Q9CUU3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
Sycp2Q9CUU3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Sycp2Q9CUU3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Sycp2Q9CUU3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
Sycp2Q9CUU3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Sycp2Q9CUU3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
Sycp2Q9CUU3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
Sycp2Q9CUU3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Sycp2Q9CUU3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Sycp2Q9CUU3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Sycp2Q9CUU3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Sycp2Q9CUU3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Sycp2Q9CUU3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Sycp2Q9CUU3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Sycp2Q9CUU3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
Sycp2Q9CUU3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Sycp2Q9CUU3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Sycp2Q9CUU3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Sycp2Q9CUU3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Sycp2Q9CUU3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Sycp2Q9CUU3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
Sycp2Q9CUU3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Sycp2Q9CUU3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Sycp2Q9CUU3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Sycp2Q9CUU3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Sycp2Q9CUU3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Sycp2Q9CUU3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Sycp2Q9CUU3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Sycp2Q9CUU3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Sycp2Q9CUU3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Sycp2Q9CUU3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Sycp2Q9CUU3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
Sycp2Q9CUU3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Sycp2Q9CUU3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Sycp2Q9CUU3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
Sycp2Q9CUU3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Sycp2Q9CUU3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Sycp2Q9CUU3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Sycp2Q9CUU3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Sycp2Q9CUU3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Sycp2Q9CUU3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
Sycp2Q9CUU3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
Sycp2Q9CUU3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC40.63■■■■■ 4.1
Sycp2Q9CUU3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Sycp2Q9CUU3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
Sycp2Q9CUU3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Sycp2Q9CUU3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Sycp2Q9CUU3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Sycp2Q9CUU3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Sycp2Q9CUU3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Sycp2Q9CUU3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Sycp2Q9CUU3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Sycp2Q9CUU3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Sycp2Q9CUU3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
Sycp2Q9CUU3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Sycp2Q9CUU3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Sycp2Q9CUU3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
Sycp2Q9CUU3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Sycp2Q9CUU3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Sycp2Q9CUU3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Sycp2Q9CUU3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Sycp2Q9CUU3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Sycp2Q9CUU3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Sycp2Q9CUU3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Sycp2Q9CUU3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Sycp2Q9CUU3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Sycp2Q9CUU3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Sycp2Q9CUU3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Sycp2Q9CUU3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
Sycp2Q9CUU3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Sycp2Q9CUU3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Sycp2Q9CUU3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Sycp2Q9CUU3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Sycp2Q9CUU3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Sycp2Q9CUU3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Sycp2Q9CUU3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Sycp2Q9CUU3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Sycp2Q9CUU3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Sycp2Q9CUU3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
Sycp2Q9CUU3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC40.51■■■■■ 4.08
Sycp2Q9CUU3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Sycp2Q9CUU3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Sycp2Q9CUU3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Sycp2Q9CUU3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Sycp2Q9CUU3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Sycp2Q9CUU3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Sycp2Q9CUU3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
Sycp2Q9CUU3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Sycp2Q9CUU3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
Sycp2Q9CUU3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
Sycp2Q9CUU3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Sycp2Q9CUU3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
Sycp2Q9CUU3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Sycp2Q9CUU3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Sycp2Q9CUU3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms