Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms