Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rprd1bQ9CSU0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms