Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRC3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CRC3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CRC3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CRC3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRC3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRC3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CRC3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CRC3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms