Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NmbQ9CR53 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms