Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR36

Gkn1, Gastrokine-1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn1Q9CR36 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gkn1Q9CR36 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gkn1Q9CR36 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gkn1Q9CR36 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gkn1Q9CR36 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gkn1Q9CR36 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Gkn1Q9CR36 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gkn1Q9CR36 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gkn1Q9CR36 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gkn1Q9CR36 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gkn1Q9CR36 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gkn1Q9CR36 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gkn1Q9CR36 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms