Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR08

Pop4, Ribonuclease P protein subunit p29, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop4Q9CR08 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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