Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr3kQ9CQZ7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Polr3kQ9CQZ7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Polr3kQ9CQZ7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Polr3kQ9CQZ7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Polr3kQ9CQZ7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Polr3kQ9CQZ7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Polr3kQ9CQZ7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Polr3kQ9CQZ7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Polr3kQ9CQZ7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Polr3kQ9CQZ7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Polr3kQ9CQZ7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Polr3kQ9CQZ7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Polr3kQ9CQZ7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Polr3kQ9CQZ7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms